是双一流大学。双一流大学一般指全球一流大学和一流学科。南京大学是全球一流大学基本建设高等院校，一流学科：社会学、中国语言文学、国外语言文学、物理、有机化学、天文学、大气科学、地貌学、分子生物学、材料科学与工程项目、电子计算机科学与技术、应用化学与技术性、矿业工程、环境生态工程与工程项目、图书情报与档案保管。
南京大学有13个进到ESI排名前1%的学科，分别是：有机化学、物理、材料科学、地球科学、分子生物学与细胞生物学、临床医学专业、工程项目科学研究、环境生态工程与生物学、药学与毒理、数学课、动植物学、电子信息科学和农业科学。
国家教育部发布全国各地第三轮学科评定結果，南京大学现有32个一级学科评为，在其中27个一级学科进到前九，16个学科进到前五，9个学科进到前三，4个学科第二，3个学科第一，在C9高等院校中排行第三。
全球一流学科基本建设学科（15个）：社会学、中国语言文学、国外语言文学、物理、有机化学、天文学、大气科学、地貌学、分子生物学、材料科学与工程项目、电子计算机科学与技术、应用化学与技术性、矿业工程、环境生态工程与工程项目、图书情报与档案保管。
