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上海市共有9所高校跻身2021中国大学排名100强，复旦大学、上海交通大学、同济大学雄居2021上海市大学排名前3强。上海大学、上海理工大学、上海中医药大学雄居2021上海市市属大学排名前3甲。

上海市大学综合实力排名靠前的院校有复旦大学、上海交大、同济大学、华东师范大学以及华东理工大学等。