黑龙江省双一流大学有哈尔滨工程大学、哈工大、东北地区林业大学、东北农业大学。哈尔滨工程大学是第一批具备博士研究生、研究生学位授予权企业，第一批“211工程”重点建设高校；2002年，获准创建研究生；2011年，变成国家“985工程”优势学科自主创新服务平台新项目建设高校；2017年，进到国家“双一流”建设队伍。
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哈工大归属于工业生产和信息化管理部，以工院为主导，工院管文经法艺等多课程共享发展，有着哈尔滨市、威海市、深圳市三个教学区。院校于1996年进到国家“211工程”第一批重点建设高校，1999年被明确为国家第一批“985工程”重点建设的9所高校之一，2000年与同根同源的哈尔滨市建筑大学合拼建立新的哈工大，2017年当选“双一流”建设A类高校名册。
东北地区林业大学是一因此林科为优点、林业工程为特色的多课程共享发展的高等院校。2005年10月，经国家国家发改委、国家财政部和国家教育部准许，变成国家“211工程”重点建设高校。2017年9月，经国务院办公厅准许列入“双一流”建设高校。
东北农业大学是一所“以农科为优点，以生物科学和食品科学为特色，农、工、理、经、管等多课程共享发展”的国家“211工程”重点建设高校和“全球一流学科”建设高校，是黑龙江市人民政府与财政部省部共建高校、国家“中西部地区高校基本工作能力建设工程项目”新项目当选高校、国家教育部大学本科课堂教学工作中水准评定出色学校。
