第四军医大学是双一流院校。中国解放军空军军医大（第四军医大学）是一所塑造高、中层级医学类专业优秀人才的全国各地名牌大学。1997年变成国家第一批22所“211工程”关键基本建设学校之一，2017年进到国家“双一流”基本建设第一批一流学科基本建设学校队伍。
院校行政机关设一办七处，所辖航天航空医学类专业、国防防止医学类专业、国防生物医学工程工程学系、药学系、军事医学心理学系、护理系、基本医科院、研究生、空军特点研究中心（北京市）、空军卫勤训练场地、第一附属医院（西京医院）、第二附属医院（唐都医院）、第三附属医院（牙科医院）、空军第九八六医院等。
院校目前本科文凭文化教育、高等教育研究、就职文化教育3个学习培训层级。院校是国务院办公厅准许的第一批博士研究生、研究生学位受权企业，目前博士研究生一级受权学科12个，研究生学位一级受权学科12个，并设立10个博士研究生流动站。现阶段有6个学科行业进到ESI全世界前1%，25个学科排行全国各地前10名。目前国家关键和培养学科19个，国家重特大科学研究基础设施建设一个，国家重点实验室两个，国家临床医学专业研究所两个，国家临床医学关键大专部队项目建设23个，军队医学专科管理中心35个，部队后勤管理科学研究试验室19个，军队医学类专业重点实验室17个。
